交锋最激烈的问题，果然是围绕着东北那些杂牌军队展开。
康梁希望调动这些军队入关，打的旗号是拱卫京畿，希望将军队调到北京。还表示，那些军队缺少束缚，在东北军纪很坏，因此希望调进关内看住，以免祸害百姓，而且也减少那些军队和沙俄军队的冲突。
东北的部队有一部分是土匪军，还有一部分是充满仇恨的子弟兵，最后一部分是学生军，至于那些铁路护路团，早就修完了铁路，转战到其他铁路工地去了。
洋务派则表示，正是因为这些军队的素质太差，才不能调到北京来。洋务派也以祸害百姓和冲突洋人为借口，要求将这些军队进行裁撤。
康梁要调兵进京，无非是确保自己的权力，保证自己的安全，不想在发生一次被袁世凯出卖这种事了。但是洋务派同样也有这种考虑，目前在北京附近最强大的军队，依然是袁世凯留下的北洋军，不过却被杨士骧统领而已。
双方以军队为核心，激烈争吵了半个多月，最后还是洋务派胜利了。
斗争结果是，裁撤东北义勇，北洋军驻扎东北。
北洋四镇新军，第一、第二两镇早就被载沣从袁世凯手中转调到了北京，分别归铁良和良弼带领；第三镇归段芝贵带领，并就任黑龙江巡抚，下辖亲领之第三镇，段祺瑞之第四镇驻扎哈尔滨；第五镇吴长春为吉林巡抚，率部驻扎吉林；第六镇为王士珍率领，驻扎奉天，名义上归奉天巡抚杨潮节制。
北洋军出关进入东北后，原本周馥编练，以袁世凯手下大将冯国璋为统制的山东新军，调到了直隶，成为直隶新军。
这样一个结果，可以说是双方争斗妥协下的产物，双方也都能接受。对北洋来说，避免了让康梁集团调东北义勇入关，威胁他们的势力。对康梁集团来说，北洋军出关驻扎东北，让他们远离了袁世凯的阴影，心理安全高了很多。
唯一的变化是，袁世凯苦心经营的北洋势力，就这样被分散到了东北广袤的土地上，不知道是袁世凯被杨士骧卖的一干二净，还是袁世凯一个新的机遇。
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